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In the chronic inflammatory microenvironment of tumors, lymphoid aggregates formed by the orderly assembly of innate and adaptive immune cells can occur within non-lymphoid tissues. Among these, mature structures possessing complete T and B cell zones and germinal centers are defined as tertiary lymphoid structures (TLSs). Numerous clinical studies have confirmed that the enrichment of TLSs in tumor tissues is closely associated with favorable prognosis in cancer patients and high response to immune checkpoint blockade (ICB) therapy, making them a highly promising novel therapeutic target in the field of cancer immunotherapy.

Tyrosine phosphorylation plays a key role in cellular signaling. In cancer studies, unregulated tyrosine kinase activity can drive malignancy and tumor formation by generating inappropriate proliferation and survival signals. Antibodies specific for phospho-tyrosine have been invaluable reagents in these studies.

The retinoblastoma tumor suppressor protein Rb regulates cell proliferation by controlling progression through the restriction point within the G1-phase of the cell cycle. Rb has three functionally distinct binding domains and interacts with critical regulatory proteins including the E2F family of transcription factors, c-Abl tyrosine kinase, and proteins with a conserved LXCXE motif. Cell cycle-dependent phosphorylation by a CDK inhibits Rb target binding and allows cell cycle progression. Rb inactivation and subsequent cell cycle progression likely requires an initial phosphorylation by cyclin D-CDK4/6 followed by cyclin E-CDK2 phosphorylation. Specificity of different CDK/cyclin complexes has been observed in vitro and cyclin D1 is required for Ser780 phosphorylation in vivo.

Rab family proteins are GTPases and members of the Ras superfamily of monomeric G proteins. These membrane-associated proteins are involved in many aspects of vesicle-mediated transport, taking part in the initial vesicle formation, transport of vesicles along the cytoskeleton, and eventual fusion of vesicle and target membranes. Rab4 is localized at early endosomes/recycling endosomes and functions as a key regulator for sorting/recycling of membrane and proteins. Both Rab4A and Rab4B isoforms are localized to similar cellular compartments and are believed to have similar functions. Rab4 interacts with several Rab4 effectors in a complex on a special endosome site to promote membrane/protein recycling.

PTEN (phosphatase and tensin homologue deleted on chromosome ten), also referred to as MMAC (mutated in multiple advanced cancers) phosphatase, is a tumor suppressor implicated in a wide variety of human cancers. PTEN encodes a 403 amino acid polypeptide originally described as a dual-specificity protein phosphatase. The main substrates of PTEN are inositol phospholipids generated by the activation of the phosphoinositide 3-kinase (PI3K). PTEN is a major negative regulator of the PI3K/Akt signaling pathway. PTEN possesses a carboxy-terminal, noncatalytic regulatory domain with three phosphorylation sites (Ser380, Thr382, and Thr383) that regulate PTEN stability and may affect its biological activity. PTEN regulates p53 protein levels and activity and is involved in G protein-coupled signaling during chemotaxis.

ALS is a fatal neurodegenerative disease. Traditional research has largely focused on limb paralysis symptoms caused by motor neuron damage; however, clinical data show that more than half of patients experience cognitive impairments beyond the motor system, with approximately 35% of patients exhibiting mild cognitive and behavioral abnormalities, primarily manifested as language deficits, executive dysfunction, and apathy. Some patients may further develop frontotemporal dementia (ALS-FTD). For a long time, the pathological mechanisms underlying the different cognitive subtypes of ALS have remained unclear, and it is not known whether the various cognitive decline phenotypes originate from a unified core pathological pathway or from specific molecular interaction abnormalities at the level of brain regions and cells. Moreover, conventional clinical diagnosis and treatment lack a refined cognitive assessment system, and existing studies cannot fully elucidate the pathological changes involving multicellular interactions in the ALS brain. TDP-43 proteinopathy, as a classic pathological hallmark of ALS, also cannot fully explain the individual differences in cognitive impairments among patients. Based on this, the study integrates clinical cognitive stratification phenotypes with multi-omics spatial mapping technology to systematically analyze cellular and molecular abnormalities in the prefrontal cortex of ALS patients, revealing specific cellular phenotypes and pathological mechanisms corresponding to different cognitive decline.

마이크로미터 크기의 세포 용해 성분은 비효율적으로 포식되어 항원 제시 세포에 흡수되지 못하므로, 후속 연쇄 면역 반응의 개시를 어렵게 만듭니다. 위와 같은 산업적 문제점을 바탕으로 본 연구는 종양 전체 세포 구성 성분의 나노백신 구축 전략을 혁신적으로 탐색하여, 수용성 항원의 단일 한계를 극복하고 종양의 수용성 및 수용불용성 전체 성분 항원을 통합하며, 백신 크기와 약물 로딩 방법을 최적화하여 치료와 예방 효과를 모두 갖는 광범위형 암 나노백신을 개발하고자 합니다.

단백질 당화 형태의 하나인 β-D-N-아세틸글루코사민 (GlcNAc) 모체가 단백질의 세린 또는 트레오닌 잔기에 추가될 수 있습니다. 이는 다른 당화 형태와 구별되며, 일반적으로 복잡한 분지당보다는 단일 모체로 이루어집니다. 이러한 변형은 인산화 변형을 연상시키는 훨씬 더 동적인 순환 과정으로 일어난다고 여겨집니다. GlcNAc 변형된 단백질은 세포질과 핵에서 발견됩니다. 이들은 특정 O-GlcNAc 전이효소 (OGT) 를 통해 조절되며, Thiamet-G (TMG) 억제제를 사용하여 GlcNAcase 활성을 억제할 수 있습니다. 이온화와 파편화 과정에서 GlcNAc 그룹의 손실로 인해 질량 분석법 분석은 복잡해졌지만, 전자 이동 분리 (ETD) 와 같은 방법 및 기술이 이러한 변형을 연구하는 새로운 길을 열어주고 있습니다. O-GlcNAc 는 대사, 성장, 형태형성, 세포자멸사, 전사 등 많은 세포 과정에서 중요한 역할을 할 수 있으며, 암에서 결정적인 역할을 할 수 있습니다.

작은 조절 단백질인 유비퀴틴은 종종 세포 내 많은 단백질에 공유 결합되어, 해당 표적 단백질이 프로테아좀에 의해 분해되도록 표시합니다. 활성화된 유비퀴틴은 먼저 E1 활성 성분과 티오에스터 복합체를 형성하여 활성화되며, 이후 유비퀴틴 운반체 단백질인 E2로 전달되고 최종적으로 표적 단백질의 리신 잔기의 ε-NH2으로 에3 유비퀴틴 리가아제에 의해 전달됩니다. 유비퀴틴-프로테아좀 경로는 다양한 정상 생물학적 과정과 질병 모두에 관여한다고 알려져 있습니다.

PROTAC(단백질 분해 표적화 키메라)은 특정 단백질을 분해하기 위해 소분류로 분류되는 화합물을 이용하는 기술이다. 이러한 소분자는 두 개의 단백질 결합 부분이 링커에 의해 연결된 헤테로 bifunctional 구조로 이루어져 있다. 분자의 한 부분은 관심 있는 단백질(POI)에 결합하고, 다른 부분은 E3 유비퀴틴 리가아제에 결합하여 E3 리가아제를 POI 에 가깝게 가져와 유비퀴틴화를 통한 단백질 분해를 유도한다. 첫 번째 성공적인 PROTAC 연구는 β-TrCP E3 리가아제를 모집하여 MetAP2 의 유비퀴틴화와 분해 를 결정하는 PROTAC-1 분량을 사용하였다. 600 개 이상의 E3 리가아제가 존재하며, 그 중 몇 개만이 PROTAC 를 통해 표적 단백질을 분해하기 위해 성공적으로 개발되었다. 이 중 CRBN 기반과 VHL 기반의 PROTAC 는 여러 질병 치료에 광범위하게 탐구되고 성공적으로 적용되어 왔다. E3 리가아제인 MDM2, c-IAP, 및 XIAP 는 암 치료를 위한 PROTAC 전략에서 유익한 것으로 입증되었다. KEAP1 E3 리가아제를 이용한 PROTAC 설계는 BRD3, BRD4, 및 Tau 의 분해를 위해 개발되었으며, KEAP1 은 PROTAC 팀의 또 다른 유망한 구성원이다.